Protein–RNA interactions for Protein: Q05AC5

4930430A15Rik, RIKEN cDNA 4930430A15, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930430A15RikQ05AC5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930430A15RikQ05AC5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930430A15RikQ05AC5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
4930430A15RikQ05AC5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930430A15RikQ05AC5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930430A15RikQ05AC5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
4930430A15RikQ05AC5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930430A15RikQ05AC5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930430A15RikQ05AC5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930430A15RikQ05AC5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
4930430A15RikQ05AC5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930430A15RikQ05AC5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930430A15RikQ05AC5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930430A15RikQ05AC5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930430A15RikQ05AC5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930430A15RikQ05AC5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930430A15RikQ05AC5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930430A15RikQ05AC5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930430A15RikQ05AC5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930430A15RikQ05AC5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930430A15RikQ05AC5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930430A15RikQ05AC5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930430A15RikQ05AC5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930430A15RikQ05AC5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930430A15RikQ05AC5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930430A15RikQ05AC5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930430A15RikQ05AC5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930430A15RikQ05AC5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930430A15RikQ05AC5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930430A15RikQ05AC5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930430A15RikQ05AC5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930430A15RikQ05AC5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930430A15RikQ05AC5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms