Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk7Q03147 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk7Q03147 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk7Q03147 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk7Q03147 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk7Q03147 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk7Q03147 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk7Q03147 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk7Q03147 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk7Q03147 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk7Q03147 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk7Q03147 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk7Q03147 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk7Q03147 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk7Q03147 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk7Q03147 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk7Q03147 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk7Q03147 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk7Q03147 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk7Q03147 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cdk7Q03147 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk7Q03147 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk7Q03147 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk7Q03147 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk7Q03147 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk7Q03147 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk7Q03147 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk7Q03147 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 904.5 ms