Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cited1P97769 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cited1P97769 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cited1P97769 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cited1P97769 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cited1P97769 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited1P97769 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cited1P97769 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cited1P97769 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cited1P97769 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cited1P97769 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cited1P97769 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cited1P97769 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited1P97769 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cited1P97769 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cited1P97769 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cited1P97769 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms