Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nbr1P97432 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nbr1P97432 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nbr1P97432 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nbr1P97432 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nbr1P97432 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Nbr1P97432 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nbr1P97432 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nbr1P97432 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nbr1P97432 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Nbr1P97432 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nbr1P97432 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Nbr1P97432 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nbr1P97432 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nbr1P97432 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nbr1P97432 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nbr1P97432 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Nbr1P97432 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nbr1P97432 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nbr1P97432 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nbr1P97432 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nbr1P97432 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nbr1P97432 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nbr1P97432 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nbr1P97432 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nbr1P97432 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nbr1P97432 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nbr1P97432 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nbr1P97432 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nbr1P97432 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
Nbr1P97432 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nbr1P97432 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nbr1P97432 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nbr1P97432 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nbr1P97432 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nbr1P97432 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nbr1P97432 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nbr1P97432 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Nbr1P97432 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nbr1P97432 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nbr1P97432 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nbr1P97432 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nbr1P97432 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Nbr1P97432 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nbr1P97432 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nbr1P97432 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nbr1P97432 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nbr1P97432 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nbr1P97432 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nbr1P97432 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nbr1P97432 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nbr1P97432 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms