Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps3aP97351 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps3aP97351 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps3aP97351 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps3aP97351 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps3aP97351 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps3aP97351 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps3aP97351 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps3aP97351 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps3aP97351 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps3aP97351 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rps3aP97351 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rps3aP97351 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps3aP97351 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps3aP97351 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps3aP97351 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps3aP97351 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps3aP97351 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps3aP97351 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps3aP97351 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps3aP97351 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rps3aP97351 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps3aP97351 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps3aP97351 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps3aP97351 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps3aP97351 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps3aP97351 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rps3aP97351 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps3aP97351 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps3aP97351 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps3aP97351 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms