Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Psmb7P70195 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psmb7P70195 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psmb7P70195 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmb7P70195 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmb7P70195 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmb7P70195 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmb7P70195 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmb7P70195 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmb7P70195 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmb7P70195 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmb7P70195 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmb7P70195 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmb7P70195 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Psmb7P70195 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmb7P70195 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psmb7P70195 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmb7P70195 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Psmb7P70195 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmb7P70195 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmb7P70195 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmb7P70195 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Psmb7P70195 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Psmb7P70195 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmb7P70195 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Psmb7P70195 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Psmb7P70195 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Psmb7P70195 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmb7P70195 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Psmb7P70195 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Psmb7P70195 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Psmb7P70195 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmb7P70195 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmb7P70195 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Psmb7P70195 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Psmb7P70195 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psmb7P70195 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Psmb7P70195 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms