Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cntn5P68500 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cntn5P68500 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntn5P68500 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntn5P68500 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cntn5P68500 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cntn5P68500 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cntn5P68500 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cntn5P68500 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cntn5P68500 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntn5P68500 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntn5P68500 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntn5P68500 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntn5P68500 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntn5P68500 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntn5P68500 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntn5P68500 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntn5P68500 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cntn5P68500 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntn5P68500 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntn5P68500 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cntn5P68500 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntn5P68500 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntn5P68500 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cntn5P68500 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntn5P68500 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cntn5P68500 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cntn5P68500 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntn5P68500 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntn5P68500 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntn5P68500 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cntn5P68500 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cntn5P68500 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cntn5P68500 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cntn5P68500 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cntn5P68500 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cntn5P68500 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntn5P68500 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntn5P68500 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntn5P68500 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cntn5P68500 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms