Protein–RNA interactions for Protein: P68433

Hist1h3a, Histone H3.1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h3aP68433 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist1h3aP68433 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist1h3aP68433 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hist1h3aP68433 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist1h3aP68433 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist1h3aP68433 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist1h3aP68433 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist1h3aP68433 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist1h3aP68433 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist1h3aP68433 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist1h3aP68433 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist1h3aP68433 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist1h3aP68433 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hist1h3aP68433 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist1h3aP68433 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist1h3aP68433 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist1h3aP68433 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist1h3aP68433 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hist1h3aP68433 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hist1h3aP68433 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hist1h3aP68433 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hist1h3aP68433 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hist1h3aP68433 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hist1h3aP68433 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hist1h3aP68433 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist1h3aP68433 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist1h3aP68433 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms