Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actg1P63260 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actg1P63260 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actg1P63260 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actg1P63260 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actg1P63260 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Actg1P63260 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actg1P63260 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actg1P63260 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Actg1P63260 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actg1P63260 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actg1P63260 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actg1P63260 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actg1P63260 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actg1P63260 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actg1P63260 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actg1P63260 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actg1P63260 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actg1P63260 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actg1P63260 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Actg1P63260 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actg1P63260 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actg1P63260 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actg1P63260 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms