Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uba52P62984 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uba52P62984 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba52P62984 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Uba52P62984 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uba52P62984 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba52P62984 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uba52P62984 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uba52P62984 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uba52P62984 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uba52P62984 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uba52P62984 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uba52P62984 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uba52P62984 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Uba52P62984 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uba52P62984 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uba52P62984 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uba52P62984 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uba52P62984 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uba52P62984 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uba52P62984 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uba52P62984 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uba52P62984 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uba52P62984 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Uba52P62984 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms