Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl31P62900 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl31P62900 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl31P62900 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl31P62900 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl31P62900 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl31P62900 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl31P62900 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl31P62900 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl31P62900 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl31P62900 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl31P62900 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl31P62900 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl31P62900 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl31P62900 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl31P62900 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rpl31P62900 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl31P62900 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl31P62900 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl31P62900 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl31P62900 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl31P62900 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl31P62900 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl31P62900 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl31P62900 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl31P62900 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl31P62900 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl31P62900 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl31P62900 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl31P62900 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl31P62900 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl31P62900 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl31P62900 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpl31P62900 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpl31P62900 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms