Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rps28P62858 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps28P62858 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps28P62858 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps28P62858 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps28P62858 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps28P62858 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps28P62858 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps28P62858 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps28P62858 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps28P62858 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps28P62858 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps28P62858 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps28P62858 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps28P62858 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms