Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab3cP62823 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab3cP62823 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab3cP62823 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab3cP62823 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab3cP62823 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab3cP62823 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab3cP62823 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab3cP62823 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab3cP62823 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3cP62823 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3cP62823 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab3cP62823 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab3cP62823 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3cP62823 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab3cP62823 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3cP62823 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab3cP62823 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3cP62823 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab3cP62823 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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