Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copz1P61924 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copz1P61924 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Copz1P61924 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copz1P61924 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copz1P61924 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copz1P61924 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copz1P61924 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copz1P61924 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copz1P61924 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Copz1P61924 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copz1P61924 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copz1P61924 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copz1P61924 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copz1P61924 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copz1P61924 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copz1P61924 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copz1P61924 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copz1P61924 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copz1P61924 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copz1P61924 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Copz1P61924 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Copz1P61924 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Copz1P61924 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Copz1P61924 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Copz1P61924 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copz1P61924 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copz1P61924 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copz1P61924 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms