Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem258P61166 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem258P61166 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem258P61166 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem258P61166 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem258P61166 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem258P61166 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem258P61166 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem258P61166 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem258P61166 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms