Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fermt1P59113 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fermt1P59113 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fermt1P59113 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fermt1P59113 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fermt1P59113 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fermt1P59113 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fermt1P59113 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fermt1P59113 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fermt1P59113 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fermt1P59113 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fermt1P59113 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fermt1P59113 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fermt1P59113 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fermt1P59113 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fermt1P59113 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fermt1P59113 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fermt1P59113 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fermt1P59113 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fermt1P59113 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fermt1P59113 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Fermt1P59113 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fermt1P59113 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fermt1P59113 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fermt1P59113 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fermt1P59113 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fermt1P59113 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fermt1P59113 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fermt1P59113 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fermt1P59113 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fermt1P59113 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fermt1P59113 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fermt1P59113 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fermt1P59113 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fermt1P59113 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms