Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Paxbp1P58501 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Paxbp1P58501 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Paxbp1P58501 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Paxbp1P58501 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Paxbp1P58501 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Paxbp1P58501 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Paxbp1P58501 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Paxbp1P58501 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Paxbp1P58501 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Paxbp1P58501 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Paxbp1P58501 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Paxbp1P58501 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Paxbp1P58501 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Paxbp1P58501 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Paxbp1P58501 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Paxbp1P58501 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Paxbp1P58501 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Paxbp1P58501 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Paxbp1P58501 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Paxbp1P58501 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Paxbp1P58501 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Paxbp1P58501 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Paxbp1P58501 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Paxbp1P58501 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Paxbp1P58501 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Paxbp1P58501 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Paxbp1P58501 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Paxbp1P58501 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Paxbp1P58501 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Paxbp1P58501 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Paxbp1P58501 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Paxbp1P58501 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Paxbp1P58501 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Paxbp1P58501 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Paxbp1P58501 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Paxbp1P58501 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Paxbp1P58501 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Paxbp1P58501 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Paxbp1P58501 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Paxbp1P58501 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms