Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Strn4P58404 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Strn4P58404 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Strn4P58404 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Strn4P58404 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Strn4P58404 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Strn4P58404 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Strn4P58404 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Strn4P58404 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Strn4P58404 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Strn4P58404 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Strn4P58404 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Strn4P58404 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Strn4P58404 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Strn4P58404 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Strn4P58404 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Strn4P58404 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Strn4P58404 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Strn4P58404 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Strn4P58404 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Strn4P58404 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Strn4P58404 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Strn4P58404 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Strn4P58404 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Strn4P58404 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Strn4P58404 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Strn4P58404 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Strn4P58404 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Strn4P58404 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Strn4P58404 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Strn4P58404 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Strn4P58404 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Strn4P58404 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Strn4P58404 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Strn4P58404 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Strn4P58404 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Strn4P58404 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Strn4P58404 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Strn4P58404 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Strn4P58404 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Strn4P58404 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Strn4P58404 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Strn4P58404 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Strn4P58404 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Strn4P58404 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Strn4P58404 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Strn4P58404 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Strn4P58404 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Strn4P58404 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Strn4P58404 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Strn4P58404 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Strn4P58404 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Strn4P58404 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Strn4P58404 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Strn4P58404 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Strn4P58404 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Strn4P58404 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Strn4P58404 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Strn4P58404 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Strn4P58404 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Strn4P58404 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Strn4P58404 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Strn4P58404 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Strn4P58404 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Strn4P58404 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Strn4P58404 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Strn4P58404 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Strn4P58404 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Strn4P58404 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Strn4P58404 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Strn4P58404 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Strn4P58404 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Strn4P58404 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Strn4P58404 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Strn4P58404 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Strn4P58404 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Strn4P58404 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms