Protein–RNA interactions for Protein: P58069

Rasa2, Ras GTPase-activating protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa2P58069 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rasa2P58069 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rasa2P58069 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rasa2P58069 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rasa2P58069 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rasa2P58069 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rasa2P58069 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rasa2P58069 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rasa2P58069 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rasa2P58069 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rasa2P58069 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rasa2P58069 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rasa2P58069 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rasa2P58069 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rasa2P58069 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rasa2P58069 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasa2P58069 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasa2P58069 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasa2P58069 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasa2P58069 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasa2P58069 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rasa2P58069 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rasa2P58069 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rasa2P58069 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rasa2P58069 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasa2P58069 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasa2P58069 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasa2P58069 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rasa2P58069 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rasa2P58069 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rasa2P58069 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rasa2P58069 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rasa2P58069 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rasa2P58069 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rasa2P58069 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rasa2P58069 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rasa2P58069 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rasa2P58069 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rasa2P58069 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasa2P58069 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasa2P58069 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rasa2P58069 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasa2P58069 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasa2P58069 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rasa2P58069 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms