Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Msh6P54276 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Msh6P54276 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Msh6P54276 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Msh6P54276 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Msh6P54276 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Msh6P54276 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Msh6P54276 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Msh6P54276 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Msh6P54276 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Msh6P54276 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Msh6P54276 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Msh6P54276 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Msh6P54276 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Msh6P54276 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Msh6P54276 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Msh6P54276 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Msh6P54276 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Msh6P54276 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Msh6P54276 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Msh6P54276 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Msh6P54276 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Msh6P54276 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Msh6P54276 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Msh6P54276 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Msh6P54276 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Msh6P54276 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Msh6P54276 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Msh6P54276 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Msh6P54276 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Msh6P54276 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Msh6P54276 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Msh6P54276 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Msh6P54276 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Msh6P54276 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Msh6P54276 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Msh6P54276 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Msh6P54276 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Msh6P54276 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Msh6P54276 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Msh6P54276 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Msh6P54276 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Msh6P54276 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Msh6P54276 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Msh6P54276 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Msh6P54276 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Msh6P54276 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Msh6P54276 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Msh6P54276 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Msh6P54276 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Msh6P54276 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Msh6P54276 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Msh6P54276 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Msh6P54276 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Msh6P54276 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Msh6P54276 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Msh6P54276 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Msh6P54276 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Msh6P54276 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Msh6P54276 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Msh6P54276 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Msh6P54276 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Msh6P54276 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Msh6P54276 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Msh6P54276 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Msh6P54276 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Msh6P54276 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Msh6P54276 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Msh6P54276 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Msh6P54276 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms