Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BckdhaP50136 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BckdhaP50136 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BckdhaP50136 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BckdhaP50136 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BckdhaP50136 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BckdhaP50136 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BckdhaP50136 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BckdhaP50136 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BckdhaP50136 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BckdhaP50136 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BckdhaP50136 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BckdhaP50136 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BckdhaP50136 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BckdhaP50136 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BckdhaP50136 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BckdhaP50136 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BckdhaP50136 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BckdhaP50136 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BckdhaP50136 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BckdhaP50136 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BckdhaP50136 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BckdhaP50136 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BckdhaP50136 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BckdhaP50136 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BckdhaP50136 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BckdhaP50136 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BckdhaP50136 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BckdhaP50136 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BckdhaP50136 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BckdhaP50136 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BckdhaP50136 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BckdhaP50136 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BckdhaP50136 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
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