Protein–RNA interactions for Protein: P49183

Dnase1, Deoxyribonuclease-1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1P49183 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnase1P49183 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dnase1P49183 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dnase1P49183 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnase1P49183 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnase1P49183 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnase1P49183 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnase1P49183 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnase1P49183 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnase1P49183 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnase1P49183 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnase1P49183 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnase1P49183 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnase1P49183 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnase1P49183 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnase1P49183 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnase1P49183 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnase1P49183 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnase1P49183 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnase1P49183 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnase1P49183 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnase1P49183 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dnase1P49183 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnase1P49183 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnase1P49183 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnase1P49183 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnase1P49183 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms