Protein–RNA interactions for Protein: P48381

Rfx3, Transcription factor RFX3, mousemouse

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx3P48381 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rfx3P48381 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfx3P48381 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfx3P48381 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfx3P48381 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rfx3P48381 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx3P48381 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx3P48381 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx3P48381 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx3P48381 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx3P48381 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx3P48381 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx3P48381 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms