Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc11P31313 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc11P31313 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc11P31313 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc11P31313 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc11P31313 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc11P31313 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc11P31313 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxc11P31313 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxc11P31313 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxc11P31313 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc11P31313 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxc11P31313 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxc11P31313 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxc11P31313 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc11P31313 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc11P31313 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc11P31313 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc11P31313 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc11P31313 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc11P31313 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc11P31313 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc11P31313 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc11P31313 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc11P31313 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc11P31313 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc11P31313 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc11P31313 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc11P31313 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc11P31313 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc11P31313 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc11P31313 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc11P31313 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc11P31313 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc11P31313 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc11P31313 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxc11P31313 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc11P31313 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc11P31313 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms