Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd40lgP27548 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd40lgP27548 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd40lgP27548 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd40lgP27548 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd40lgP27548 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd40lgP27548 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd40lgP27548 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd40lgP27548 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd40lgP27548 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd40lgP27548 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd40lgP27548 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd40lgP27548 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd40lgP27548 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd40lgP27548 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd40lgP27548 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd40lgP27548 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd40lgP27548 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd40lgP27548 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd40lgP27548 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd40lgP27548 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd40lgP27548 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd40lgP27548 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd40lgP27548 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd40lgP27548 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms