Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Aldh1a1P24549 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Aldh1a1P24549 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Aldh1a1P24549 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Aldh1a1P24549 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Aldh1a1P24549 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Aldh1a1P24549 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Aldh1a1P24549 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Aldh1a1P24549 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aldh1a1P24549 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Aldh1a1P24549 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Aldh1a1P24549 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Aldh1a1P24549 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Aldh1a1P24549 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Aldh1a1P24549 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Aldh1a1P24549 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Aldh1a1P24549 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Aldh1a1P24549 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Aldh1a1P24549 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Aldh1a1P24549 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Aldh1a1P24549 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Aldh1a1P24549 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Aldh1a1P24549 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Aldh1a1P24549 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Aldh1a1P24549 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Aldh1a1P24549 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Aldh1a1P24549 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Aldh1a1P24549 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Aldh1a1P24549 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Aldh1a1P24549 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Aldh1a1P24549 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aldh1a1P24549 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Aldh1a1P24549 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Aldh1a1P24549 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Aldh1a1P24549 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aldh1a1P24549 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Aldh1a1P24549 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aldh1a1P24549 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aldh1a1P24549 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Aldh1a1P24549 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aldh1a1P24549 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aldh1a1P24549 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aldh1a1P24549 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aldh1a1P24549 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aldh1a1P24549 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Aldh1a1P24549 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aldh1a1P24549 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Aldh1a1P24549 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Aldh1a1P24549 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms