Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcmt1P23506 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcmt1P23506 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcmt1P23506 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmt1P23506 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmt1P23506 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcmt1P23506 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcmt1P23506 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcmt1P23506 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcmt1P23506 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmt1P23506 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcmt1P23506 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcmt1P23506 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcmt1P23506 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcmt1P23506 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcmt1P23506 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcmt1P23506 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcmt1P23506 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcmt1P23506 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcmt1P23506 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcmt1P23506 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcmt1P23506 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcmt1P23506 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcmt1P23506 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcmt1P23506 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcmt1P23506 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms