Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VimP20152 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VimP20152 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VimP20152 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VimP20152 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VimP20152 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VimP20152 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VimP20152 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VimP20152 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VimP20152 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VimP20152 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VimP20152 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VimP20152 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VimP20152 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VimP20152 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VimP20152 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VimP20152 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VimP20152 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VimP20152 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VimP20152 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VimP20152 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VimP20152 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VimP20152 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VimP20152 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VimP20152 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VimP20152 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VimP20152 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VimP20152 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VimP20152 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VimP20152 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VimP20152 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VimP20152 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VimP20152 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VimP20152 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VimP20152 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VimP20152 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VimP20152 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VimP20152 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
VimP20152 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VimP20152 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VimP20152 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VimP20152 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VimP20152 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VimP20152 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VimP20152 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VimP20152 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VimP20152 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VimP20152 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VimP20152 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VimP20152 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VimP20152 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VimP20152 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VimP20152 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VimP20152 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VimP20152 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VimP20152 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VimP20152 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VimP20152 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VimP20152 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VimP20152 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VimP20152 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VimP20152 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VimP20152 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VimP20152 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VimP20152 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VimP20152 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VimP20152 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VimP20152 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VimP20152 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VimP20152 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VimP20152 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VimP20152 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VimP20152 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VimP20152 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VimP20152 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VimP20152 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VimP20152 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VimP20152 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VimP20152 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VimP20152 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VimP20152 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VimP20152 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VimP20152 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VimP20152 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VimP20152 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VimP20152 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VimP20152 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VimP20152 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VimP20152 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VimP20152 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VimP20152 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VimP20152 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VimP20152 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VimP20152 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VimP20152 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VimP20152 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VimP20152 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VimP20152 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VimP20152 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VimP20152 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms