Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl13aP19253 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl13aP19253 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl13aP19253 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpl13aP19253 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl13aP19253 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl13aP19253 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl13aP19253 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl13aP19253 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13aP19253 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl13aP19253 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl13aP19253 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13aP19253 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl13aP19253 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl13aP19253 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl13aP19253 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl13aP19253 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms