Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NefhP19246 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NefhP19246 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefhP19246 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NefhP19246 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefhP19246 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NefhP19246 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefhP19246 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NefhP19246 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NefhP19246 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NefhP19246 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NefhP19246 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NefhP19246 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NefhP19246 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefhP19246 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NefhP19246 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NefhP19246 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NefhP19246 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NefhP19246 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NefhP19246 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NefhP19246 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NefhP19246 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NefhP19246 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NefhP19246 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NefhP19246 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NefhP19246 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NefhP19246 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NefhP19246 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NefhP19246 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefhP19246 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NefhP19246 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NefhP19246 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NefhP19246 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NefhP19246 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefhP19246 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NefhP19246 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NefhP19246 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NefhP19246 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NefhP19246 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NefhP19246 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NefhP19246 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NefhP19246 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NefhP19246 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NefhP19246 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NefhP19246 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NefhP19246 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NefhP19246 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NefhP19246 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NefhP19246 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NefhP19246 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NefhP19246 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NefhP19246 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefhP19246 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefhP19246 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefhP19246 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NefhP19246 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefhP19246 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefhP19246 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NefhP19246 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefhP19246 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefhP19246 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NefhP19246 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefhP19246 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefhP19246 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefhP19246 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefhP19246 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefhP19246 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefhP19246 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NefhP19246 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NefhP19246 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NefhP19246 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefhP19246 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefhP19246 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefhP19246 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefhP19246 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NefhP19246 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefhP19246 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefhP19246 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NefhP19246 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefhP19246 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NefhP19246 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NefhP19246 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NefhP19246 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NefhP19246 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NefhP19246 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NefhP19246 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NefhP19246 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NefhP19246 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NefhP19246 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NefhP19246 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NefhP19246 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NefhP19246 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NefhP19246 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NefhP19246 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefhP19246 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NefhP19246 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NefhP19246 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefhP19246 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NefhP19246 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NefhP19246 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms