Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
P18529 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18529 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18529 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18529 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18529 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18529 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P18529 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18529 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18529 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18529 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18529 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18529 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P18529 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18529 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18529 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18529 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P18529 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P18529 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P18529 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P18529 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P18529 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P18529 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P18529 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P18529 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P18529 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P18529 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P18529 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P18529 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P18529 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P18529 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P18529 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18529 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18529 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18529 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18529 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18529 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18529 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18529 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P18529 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18529 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18529 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18529 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18529 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P18529 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P18529 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P18529 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P18529 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18529 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18529 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18529 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P18529 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P18529 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P18529 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18529 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18529 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18529 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18529 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P18529 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P18529 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
P18529 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P18529 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
P18529 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
P18529 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18529 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18529 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18529 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18529 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P18529 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
P18529 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
P18529 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P18529 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P18529 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P18529 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
P18529 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
P18529 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
P18529 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
P18529 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
P18529 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
P18529 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
P18529 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
P18529 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
P18529 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
P18529 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P18529 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P18529 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P18529 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P18529 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
P18529 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
P18529 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P18529 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P18529 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P18529 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P18529 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P18529 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
P18529 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
P18529 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
P18529 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
P18529 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
P18529 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms