Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18527 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18527 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18527 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18527 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P18527 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P18527 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18527 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P18527 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P18527 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P18527 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18527 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P18527 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P18527 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18527 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P18527 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P18527 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P18527 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18527 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P18527 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18527 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P18527 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P18527 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18527 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18527 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P18527 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P18527 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P18527 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
P18527 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18527 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P18527 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P18527 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P18527 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18527 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18527 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18527 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18527 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18527 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18527 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P18527 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18527 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18527 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18527 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18527 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18527 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18527 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18527 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18527 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18527 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18527 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P18527 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P18527 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P18527 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P18527 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18527 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18527 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18527 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18527 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18527 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18527 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18527 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18527 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18527 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P18527 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P18527 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P18527 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P18527 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P18527 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P18527 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P18527 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P18527 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P18527 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P18527 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P18527 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P18527 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P18527 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18527 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18527 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18527 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P18527 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18527 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18527 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18527 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P18527 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P18527 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18527 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P18527 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms