Protein–RNA interactions for Protein: P11798

Camk2a, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2aP11798 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Camk2aP11798 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Camk2aP11798 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Camk2aP11798 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Camk2aP11798 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Camk2aP11798 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Camk2aP11798 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Camk2aP11798 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Camk2aP11798 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Camk2aP11798 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Camk2aP11798 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Camk2aP11798 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Camk2aP11798 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Camk2aP11798 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Camk2aP11798 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Camk2aP11798 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Camk2aP11798 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Camk2aP11798 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Camk2aP11798 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Camk2aP11798 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Camk2aP11798 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Camk2aP11798 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Camk2aP11798 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Camk2aP11798 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Camk2aP11798 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Camk2aP11798 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Camk2aP11798 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Camk2aP11798 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Camk2aP11798 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Camk2aP11798 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Camk2aP11798 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Camk2aP11798 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Camk2aP11798 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Camk2aP11798 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Camk2aP11798 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Camk2aP11798 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Camk2aP11798 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Camk2aP11798 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Camk2aP11798 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Camk2aP11798 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Camk2aP11798 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Camk2aP11798 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Camk2aP11798 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Camk2aP11798 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms