Protein–RNA interactions for Protein: P11610

Cd1d2, Antigen-presenting glycoprotein CD1d2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d2P11610 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd1d2P11610 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd1d2P11610 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd1d2P11610 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd1d2P11610 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd1d2P11610 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd1d2P11610 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd1d2P11610 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd1d2P11610 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd1d2P11610 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd1d2P11610 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd1d2P11610 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd1d2P11610 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd1d2P11610 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd1d2P11610 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd1d2P11610 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd1d2P11610 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd1d2P11610 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd1d2P11610 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd1d2P11610 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd1d2P11610 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd1d2P11610 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd1d2P11610 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd1d2P11610 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd1d2P11610 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd1d2P11610 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cd1d2P11610 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms