Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcea1P10711 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcea1P10711 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcea1P10711 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcea1P10711 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcea1P10711 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcea1P10711 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcea1P10711 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcea1P10711 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcea1P10711 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcea1P10711 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcea1P10711 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcea1P10711 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcea1P10711 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcea1P10711 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcea1P10711 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tcea1P10711 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tcea1P10711 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tcea1P10711 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcea1P10711 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcea1P10711 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tcea1P10711 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcea1P10711 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcea1P10711 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms