Protein–RNA interactions for Protein: P0DM40

Fer1l5, Fer-1-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 2,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l5P0DM40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fer1l5P0DM40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fer1l5P0DM40 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fer1l5P0DM40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fer1l5P0DM40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fer1l5P0DM40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fer1l5P0DM40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fer1l5P0DM40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fer1l5P0DM40 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fer1l5P0DM40 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fer1l5P0DM40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fer1l5P0DM40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fer1l5P0DM40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fer1l5P0DM40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fer1l5P0DM40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fer1l5P0DM40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fer1l5P0DM40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fer1l5P0DM40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fer1l5P0DM40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fer1l5P0DM40 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fer1l5P0DM40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fer1l5P0DM40 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fer1l5P0DM40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fer1l5P0DM40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fer1l5P0DM40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fer1l5P0DM40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fer1l5P0DM40 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fer1l5P0DM40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fer1l5P0DM40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fer1l5P0DM40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fer1l5P0DM40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fer1l5P0DM40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fer1l5P0DM40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fer1l5P0DM40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fer1l5P0DM40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms