Protein–RNA interactions for Protein: P0CG50

Ubc, Polyubiquitin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbcP0CG50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UbcP0CG50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UbcP0CG50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UbcP0CG50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UbcP0CG50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UbcP0CG50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UbcP0CG50 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UbcP0CG50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UbcP0CG50 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UbcP0CG50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UbcP0CG50 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UbcP0CG50 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UbcP0CG50 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UbcP0CG50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UbcP0CG50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UbcP0CG50 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UbcP0CG50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UbcP0CG50 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UbcP0CG50 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UbcP0CG50 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UbcP0CG50 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UbcP0CG50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms