Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf3P09920 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf3P09920 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf3P09920 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3P09920 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf3P09920 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf3P09920 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf3P09920 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf3P09920 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3P09920 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3P09920 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csf3P09920 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3P09920 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3P09920 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csf3P09920 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csf3P09920 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csf3P09920 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf3P09920 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3P09920 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf3P09920 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf3P09920 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3P09920 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf3P09920 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csf3P09920 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf3P09920 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf3P09920 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3P09920 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3P09920 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3P09920 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf3P09920 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms