Protein–RNA interactions for Protein: P03930

Mtatp8, ATP synthase protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp8P03930 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp8P03930 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtatp8P03930 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp8P03930 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtatp8P03930 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp8P03930 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtatp8P03930 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtatp8P03930 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mtatp8P03930 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mtatp8P03930 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtatp8P03930 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mtatp8P03930 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mtatp8P03930 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtatp8P03930 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms