Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lamc1P02468 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lamc1P02468 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lamc1P02468 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Lamc1P02468 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Lamc1P02468 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Lamc1P02468 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Lamc1P02468 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Lamc1P02468 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Lamc1P02468 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lamc1P02468 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lamc1P02468 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lamc1P02468 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Lamc1P02468 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lamc1P02468 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lamc1P02468 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lamc1P02468 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
Lamc1P02468 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Lamc1P02468 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc1P02468 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc1P02468 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc1P02468 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc1P02468 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Lamc1P02468 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lamc1P02468 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Lamc1P02468 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Lamc1P02468 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lamc1P02468 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lamc1P02468 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Lamc1P02468 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Lamc1P02468 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lamc1P02468 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lamc1P02468 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lamc1P02468 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Lamc1P02468 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lamc1P02468 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Lamc1P02468 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lamc1P02468 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lamc1P02468 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Lamc1P02468 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc1P02468 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lamc1P02468 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lamc1P02468 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lamc1P02468 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lamc1P02468 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lamc1P02468 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lamc1P02468 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lamc1P02468 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lamc1P02468 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Lamc1P02468 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lamc1P02468 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lamc1P02468 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Lamc1P02468 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lamc1P02468 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lamc1P02468 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lamc1P02468 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Lamc1P02468 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lamc1P02468 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Lamc1P02468 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lamc1P02468 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lamc1P02468 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lamc1P02468 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Lamc1P02468 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Lamc1P02468 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Lamc1P02468 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Lamc1P02468 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lamc1P02468 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lamc1P02468 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Lamc1P02468 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms