Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-AaP01910 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-AaP01910 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-AaP01910 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-AaP01910 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-AaP01910 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-AaP01910 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-AaP01910 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-AaP01910 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2-AaP01910 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-AaP01910 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2-AaP01910 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-AaP01910 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-AaP01910 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-AaP01910 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-AaP01910 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-AaP01910 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-AaP01910 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2-AaP01910 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H2-AaP01910 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H2-AaP01910 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2-AaP01910 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms