Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RradO88667 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RradO88667 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RradO88667 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RradO88667 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RradO88667 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RradO88667 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RradO88667 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RradO88667 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RradO88667 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RradO88667 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RradO88667 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RradO88667 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RradO88667 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RradO88667 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RradO88667 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RradO88667 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RradO88667 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RradO88667 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RradO88667 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RradO88667 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RradO88667 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RradO88667 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RradO88667 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RradO88667 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RradO88667 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RradO88667 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RradO88667 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RradO88667 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RradO88667 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RradO88667 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RradO88667 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RradO88667 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RradO88667 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RradO88667 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RradO88667 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RradO88667 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RradO88667 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RradO88667 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RradO88667 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RradO88667 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RradO88667 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RradO88667 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RradO88667 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RradO88667 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RradO88667 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RradO88667 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RradO88667 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RradO88667 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RradO88667 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RradO88667 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RradO88667 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RradO88667 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RradO88667 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RradO88667 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RradO88667 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RradO88667 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RradO88667 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RradO88667 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RradO88667 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RradO88667 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RradO88667 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RradO88667 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RradO88667 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RradO88667 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RradO88667 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RradO88667 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RradO88667 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RradO88667 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RradO88667 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RradO88667 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RradO88667 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RradO88667 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RradO88667 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RradO88667 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RradO88667 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RradO88667 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RradO88667 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RradO88667 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RradO88667 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RradO88667 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RradO88667 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RradO88667 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RradO88667 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RradO88667 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RradO88667 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RradO88667 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RradO88667 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RradO88667 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RradO88667 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RradO88667 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RradO88667 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RradO88667 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RradO88667 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RradO88667 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RradO88667 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RradO88667 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RradO88667 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RradO88667 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RradO88667 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms