Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnmt3bO88509 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt3bO88509 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnmt3bO88509 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dnmt3bO88509 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Dnmt3bO88509 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dnmt3bO88509 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnmt3bO88509 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnmt3bO88509 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt3bO88509 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnmt3bO88509 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3bO88509 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnmt3bO88509 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnmt3bO88509 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt3bO88509 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt3bO88509 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt3bO88509 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt3bO88509 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt3bO88509 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnmt3bO88509 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3bO88509 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3bO88509 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3bO88509 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt3bO88509 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3bO88509 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt3bO88509 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnmt3bO88509 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt3bO88509 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt3bO88509 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt3bO88509 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnmt3bO88509 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt3bO88509 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms