Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CaskO70589 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CaskO70589 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CaskO70589 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CaskO70589 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CaskO70589 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CaskO70589 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CaskO70589 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CaskO70589 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CaskO70589 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CaskO70589 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CaskO70589 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CaskO70589 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CaskO70589 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CaskO70589 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CaskO70589 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CaskO70589 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CaskO70589 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CaskO70589 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CaskO70589 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaskO70589 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CaskO70589 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CaskO70589 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaskO70589 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaskO70589 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CaskO70589 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaskO70589 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CaskO70589 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CaskO70589 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CaskO70589 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CaskO70589 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CaskO70589 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CaskO70589 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaskO70589 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaskO70589 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CaskO70589 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CaskO70589 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CaskO70589 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CaskO70589 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CaskO70589 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CaskO70589 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CaskO70589 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CaskO70589 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CaskO70589 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CaskO70589 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CaskO70589 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaskO70589 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CaskO70589 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CaskO70589 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CaskO70589 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CaskO70589 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CaskO70589 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaskO70589 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaskO70589 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaskO70589 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CaskO70589 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CaskO70589 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CaskO70589 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaskO70589 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaskO70589 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CaskO70589 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaskO70589 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaskO70589 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CaskO70589 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CaskO70589 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaskO70589 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaskO70589 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaskO70589 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CaskO70589 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CaskO70589 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CaskO70589 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CaskO70589 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaskO70589 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CaskO70589 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaskO70589 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CaskO70589 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CaskO70589 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CaskO70589 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CaskO70589 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaskO70589 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaskO70589 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CaskO70589 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaskO70589 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CaskO70589 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CaskO70589 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CaskO70589 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CaskO70589 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CaskO70589 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaskO70589 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaskO70589 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CaskO70589 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CaskO70589 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CaskO70589 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CaskO70589 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CaskO70589 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaskO70589 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaskO70589 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaskO70589 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CaskO70589 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CaskO70589 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252 ms