Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IlkO55222 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IlkO55222 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IlkO55222 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IlkO55222 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IlkO55222 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IlkO55222 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IlkO55222 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IlkO55222 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IlkO55222 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IlkO55222 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IlkO55222 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IlkO55222 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IlkO55222 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IlkO55222 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IlkO55222 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IlkO55222 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IlkO55222 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IlkO55222 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IlkO55222 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IlkO55222 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IlkO55222 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IlkO55222 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IlkO55222 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IlkO55222 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IlkO55222 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
IlkO55222 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IlkO55222 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IlkO55222 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IlkO55222 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IlkO55222 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IlkO55222 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IlkO55222 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IlkO55222 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IlkO55222 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IlkO55222 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IlkO55222 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IlkO55222 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IlkO55222 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IlkO55222 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IlkO55222 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IlkO55222 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IlkO55222 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IlkO55222 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IlkO55222 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IlkO55222 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IlkO55222 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IlkO55222 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IlkO55222 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IlkO55222 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IlkO55222 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IlkO55222 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IlkO55222 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IlkO55222 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IlkO55222 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IlkO55222 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IlkO55222 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IlkO55222 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IlkO55222 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IlkO55222 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IlkO55222 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IlkO55222 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IlkO55222 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IlkO55222 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IlkO55222 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IlkO55222 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IlkO55222 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IlkO55222 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IlkO55222 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IlkO55222 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IlkO55222 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IlkO55222 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IlkO55222 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IlkO55222 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IlkO55222 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IlkO55222 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IlkO55222 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IlkO55222 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IlkO55222 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IlkO55222 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IlkO55222 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IlkO55222 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IlkO55222 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IlkO55222 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IlkO55222 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IlkO55222 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IlkO55222 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IlkO55222 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IlkO55222 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
IlkO55222 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IlkO55222 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IlkO55222 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IlkO55222 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IlkO55222 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms