Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2a2O55143 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atp2a2O55143 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2a2O55143 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2a2O55143 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2a2O55143 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2a2O55143 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2a2O55143 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp2a2O55143 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2a2O55143 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2a2O55143 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2a2O55143 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2a2O55143 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2a2O55143 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2a2O55143 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2a2O55143 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2a2O55143 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2a2O55143 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2a2O55143 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2a2O55143 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2a2O55143 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2a2O55143 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp2a2O55143 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp2a2O55143 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atp2a2O55143 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp2a2O55143 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp2a2O55143 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2a2O55143 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp2a2O55143 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp2a2O55143 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp2a2O55143 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms