Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd200O54901 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd200O54901 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd200O54901 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd200O54901 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd200O54901 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd200O54901 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd200O54901 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd200O54901 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd200O54901 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd200O54901 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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