Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lgals6O54891 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgals6O54891 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgals6O54891 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lgals6O54891 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgals6O54891 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgals6O54891 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lgals6O54891 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lgals6O54891 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgals6O54891 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms