Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tpd52l1O54818 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tpd52l1O54818 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tpd52l1O54818 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tpd52l1O54818 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tpd52l1O54818 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tpd52l1O54818 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tpd52l1O54818 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tpd52l1O54818 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tpd52l1O54818 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tpd52l1O54818 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tpd52l1O54818 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tpd52l1O54818 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tpd52l1O54818 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Tpd52l1O54818 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tpd52l1O54818 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tpd52l1O54818 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tpd52l1O54818 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tpd52l1O54818 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tpd52l1O54818 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tpd52l1O54818 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tpd52l1O54818 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tpd52l1O54818 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tpd52l1O54818 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tpd52l1O54818 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tpd52l1O54818 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tpd52l1O54818 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tpd52l1O54818 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms