Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NudcO35685 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NudcO35685 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NudcO35685 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NudcO35685 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NudcO35685 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NudcO35685 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NudcO35685 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NudcO35685 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NudcO35685 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NudcO35685 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NudcO35685 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NudcO35685 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NudcO35685 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NudcO35685 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NudcO35685 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NudcO35685 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NudcO35685 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NudcO35685 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
NudcO35685 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NudcO35685 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NudcO35685 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NudcO35685 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NudcO35685 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NudcO35685 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NudcO35685 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NudcO35685 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NudcO35685 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NudcO35685 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NudcO35685 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NudcO35685 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NudcO35685 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NudcO35685 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NudcO35685 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NudcO35685 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NudcO35685 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NudcO35685 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NudcO35685 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NudcO35685 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NudcO35685 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NudcO35685 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NudcO35685 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NudcO35685 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NudcO35685 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NudcO35685 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NudcO35685 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NudcO35685 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NudcO35685 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NudcO35685 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NudcO35685 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NudcO35685 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NudcO35685 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NudcO35685 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NudcO35685 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NudcO35685 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NudcO35685 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NudcO35685 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NudcO35685 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NudcO35685 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NudcO35685 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NudcO35685 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NudcO35685 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NudcO35685 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NudcO35685 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NudcO35685 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NudcO35685 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NudcO35685 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NudcO35685 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NudcO35685 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NudcO35685 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NudcO35685 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NudcO35685 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NudcO35685 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NudcO35685 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NudcO35685 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NudcO35685 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NudcO35685 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NudcO35685 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NudcO35685 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NudcO35685 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NudcO35685 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NudcO35685 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NudcO35685 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NudcO35685 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NudcO35685 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NudcO35685 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NudcO35685 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NudcO35685 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NudcO35685 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NudcO35685 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NudcO35685 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NudcO35685 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NudcO35685 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NudcO35685 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NudcO35685 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NudcO35685 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NudcO35685 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NudcO35685 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NudcO35685 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NudcO35685 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms